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但是，此次调查采访中，两个政府用户对于Linux的看法和态度却显现了目前在电子政务中Linux推广的一些尴尬。“实际应用中，感觉并不好，没有想像中的稳定，”北京东城区政府系统部的一个工作人员对其采用了Linux的委办局网上办公系统的评价并不高。同样，广东云浮市信息产业局莫少斌对其Linux试点项目中Linux的表现也提出了不少的问题，“兼容性、稳定性、易操作性都是问题，当然了，这其中接触Linux的人比较少有关系，特别是在桌面系统上。”
虽然在使用中存在一些不尽如人意的问题，但这丝毫没有影响政府推广Linux的决心。 8月9日，广东省信息产业厅公布了广东省第一批电子政务 Linux应用试点单位。首批试点项目包括下列7家单位：广州市黄埔区政府电子政务平台Linux应用试点项目、佛山市南海区西樵镇政府电子政务综合平台系统Linux应用试点项目、广东省机械设备成套局广东省电子化政府采购操作执行平台Linux应用试点项目、东莞市公安局电子警务信息发布平台建设试点项目、佛山市南海区卫生局社区服务卫生信息系统Linux应用试点项目、佛山市南海区民政局民政管理信息系统Linux试点项目、云浮市信息中心云浮市电子政务Linux应用整体推进试点项目。“虽然推进Linux已经有两三年的时间了，但是应用的情况一直不太乐观，”莫少斌说，“希望在省政府的支持下，情况会有所好转。”
在不需要海量计算和成本控制的政府机构，电子政务系统对于Linux的需要被不少人单方面地理解为我国政府推广Linux应用的试验田。但也有专家认为，电子政务系统采用Linux，一方面是出于大力推广国产软件，另一方面出于对安全性的考虑。“如果都采用Windows产品，政府的信息安全会成为很大的问题，”业内专家孙斌表示，“政府也不愿意看见操作系统的核心部分被某一个国外厂商所把持，所以，无论从哪个方面来讲，推广Linux都是我国政府必然的选择。”
推行是势在必行的，而软件正版化和政府采购成了Linux在政府推广的主要途径。据了解，广东省还要求在省内新开展的电子政务中服务器端必须采用Linux，而这个会通过“政策和财政”来保证，也就是如果不采用Linux的话，财政的拨款就会有问题。同时，对于列入政府采购目录的产品，广东省也做出了一定的要求：所有Linux的产品必须要通过Linux公共服务技术支持中心的测试才可以列入政府采购名单。
“这主要是要保证Linux的可用性，”袁泉说，“政府还是担心Linux会出现用不起来的情况，所以需要我们做出对其可用性的评估，不仅仅在 Linux操作系统，还有相关的很多应用软件。